More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1372 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 701 aa  1432    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 700 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 688 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.24 
 
 		 706 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.9 
 
 		 706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.24 
 
 		 706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.24 
 
 		 706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.07 
 
 		 721 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 700 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 700 aa  171  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 700 aa  171  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 700 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.38 
 
 		 700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.38 
 
 		 700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 709 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 728 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 675 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 694 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 742 aa  152  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 726 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 720 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 706 aa  143  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.36 
 
 		 726 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 718 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 731 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 680 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 705 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 734 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.21 
 
 		 727 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 705 aa  130  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 711 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 697 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 692 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 791 aa  124  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 779 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  21.5 
 
 		 691 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 702 aa  121  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 720 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 696 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 705 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.94 
 
 		 712 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 742 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  24.58 
 
 		 762 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 737 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 682 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 736 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  20.48 
 
 		 743 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  21.55 
 
 		 710 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 703 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 716 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  20 
 
 		 681 aa  111  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 678 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  21.86 
 
 		 730 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 723 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 782 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  21.37 
 
 		 723 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  21.86 
 
 		 730 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  21.53 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 757 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 706 aa  104  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 737 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.88 
 
 		 782 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.68 
 
 		 774 aa  104  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.68 
 
 		 774 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.68 
 
 		 774 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.24 
 
 		 774 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 774 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  20.68 
 
 		 746 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 774 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 774 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  21.02 
 
 		 693 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 705 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 777 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 721 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  22.56 
 
 		 715 aa  99  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 671 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 710 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 699 aa  97.8  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 721 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 736 aa  97.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 780 aa  97.4  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  20.96 
 
 		 708 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  22.8 
 
 		 712 aa  97.4  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 706 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 688 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.88 
 
 		 861 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  22.01 
 
 		 721 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  21.25 
 
 		 728 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>