151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0033 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  84.21 
 
 		 250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  84.21 
 
 		 250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  53.85 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  51.03 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  50.85 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  52.32 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  49.15 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  44.13 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  45.87 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  42.32 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  42.8 
 
 		 220 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  41.7 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  43.42 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  38.27 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  31.25 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  34.92 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  30.84 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  35.15 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  34.5 
 
 		 320 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  32.16 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  34.73 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  34.31 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  34.35 
 
 		 268 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  33.2 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  34.39 
 
 		 306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  33.73 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  33.33 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  33.05 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  32.08 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  33.75 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  33.2 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  31.25 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.07 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.07 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  31.38 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  32.08 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  32.68 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  31.72 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  30.84 
 
 		 273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  30.38 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  30.5 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  27.8 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  30.97 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  30.97 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  30.8 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  30.97 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  30.8 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  29.41 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  31.91 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  30.39 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  28.57 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  28.22 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  29.55 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.79 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  26.42 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  31.55 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.97 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  27.12 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  26.61 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  25.82 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.45 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.45 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.45 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.45 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.66 
 
 		 213 aa  72  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.45 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.64 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.2 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  27.78 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  28.07 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.58 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.25 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.76 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.58 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  26.23 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.49 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  26.38 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  26.86 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.19 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  26.97 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  27.46 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  26.87 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  26.88 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.87 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  23.61 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  29.95 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  25.1 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  24.32 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  21.74 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.21 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.03 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  26.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  24.71 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  23.58 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25.29 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  25 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>