More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1456 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  84.86 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  48.11 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  51.88 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  51.88 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.82 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  49.63 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.33 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45.21 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.79 
 
 		 294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  45.93 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.7 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  48.86 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  46.97 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  47.41 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  45.07 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  51.25 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  48.25 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  45.49 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.52 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  45.52 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.95 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  44.03 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  48.43 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  44.49 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  48.24 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  41.96 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  46.34 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.2 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  43.18 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.97 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  40.83 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  48.13 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  45.83 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  42 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3075  Polyprenyl synthetase  52.78 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.75 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  44.02 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.86 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  47.21 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  48.5 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.03 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  49.44 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  40.56 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.22 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  42.18 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  50.21 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  44.53 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  44.53 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  47.41 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.82 
 
 		 293 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  49.39 
 
 		 291 aa  205  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  47.6 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  42.61 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.45 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  48.78 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  40.59 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  50.2 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  48.57 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  39.59 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  47.01 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  47.1 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.04 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.88 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  47.01 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  44.93 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  44.6 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  44.29 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  46.82 
 
 		 321 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  44.6 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  44.6 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  41.13 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  44.6 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  44.6 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  44.6 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  45.8 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  44.6 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  45.8 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.34 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.12 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.49 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>