236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2344 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 423 aa  833    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  84.87 
 
 		 423 aa  721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  85.11 
 
 		 423 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  84.87 
 
 		 423 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  78.44 
 
 		 424 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  78.01 
 
 		 423 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  77.53 
 
 		 422 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  74.94 
 
 		 423 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  73.27 
 
 		 425 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  59.48 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  49.88 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  50.86 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  32.56 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  34.26 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  30.46 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  34.24 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  33.67 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  34.59 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  34 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  34 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 443 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  34 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  34.37 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.85 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  30.56 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  29.28 
 
 		 394 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  30.9 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  31.45 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  30.38 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  29.93 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  32.43 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  32.43 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  30.63 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  32.43 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  32.43 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  32.43 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  32.43 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  32.43 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  30.39 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  31.31 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  31.27 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  29.05 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  27.9 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  31.49 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  29.27 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  32.86 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25.62 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  29.41 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.89 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  30.98 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  27.13 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  25.62 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  32.23 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  25.3 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 424 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  28.72 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  26.6 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  28.68 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  31.07 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  27.85 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  28.92 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  32.1 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  25.76 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.41 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  26.58 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2803  outer membrane efflux protein  31.01 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.887689  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  20.76 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>