103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4300 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  68.19 
 
 		 1111 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  57.08 
 
 		 1180 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  69.69 
 
 		 1130 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 987 aa  1872    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  64.64 
 
 		 1081 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  51.25 
 
 		 882 aa  595  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  57.52 
 
 		 2407 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  53.42 
 
 		 1019 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  54.86 
 
 		 814 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  51.35 
 
 		 1078 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  52.4 
 
 		 907 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.4 
 
 		 1532 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  36.33 
 
 		 1177 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  36.36 
 
 		 678 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  50.71 
 
 		 190 aa  129  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.78 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  28.93 
 
 		 1152 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  25.25 
 
 		 1519 aa  111  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.78 
 
 		 1508 aa  108  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.27 
 
 		 1489 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 		 1033 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  43.33 
 
 		 1055 aa  102  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1881 aa  99.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  42.58 
 
 		 983 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  43.54 
 
 		 1028 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.51 
 
 		 1769 aa  100  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  43.33 
 
 		 1004 aa  99.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 2003 aa  98.6  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.62 
 
 		 1119 aa  95.9  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  45.75 
 
 		 1571 aa  95.5  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.12 
 
 		 1285 aa  94  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  41.55 
 
 		 995 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.49 
 
 		 2396 aa  92.8  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  37.72 
 
 		 995 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  35.16 
 
 		 1459 aa  91.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  37.13 
 
 		 991 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.49 
 
 		 1011 aa  89.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  42.19 
 
 		 1001 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.67 
 
 		 919 aa  88.2  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.2 
 
 		 1227 aa  87.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  40.14 
 
 		 986 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  40 
 
 		 1053 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  34.15 
 
 		 1458 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  42.19 
 
 		 1001 aa  85.1  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 		 1056 aa  85.1  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 		 2366 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  28.81 
 
 		 2371 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  41.22 
 
 		 1038 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.29 
 
 		 1322 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  40.91 
 
 		 2906 aa  78.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.29 
 
 		 1848 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 		 1333 aa  76.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.97 
 
 		 1125 aa  75.5  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 1179 aa  74.7  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  38.12 
 
 		 1068 aa  74.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  25.69 
 
 		 1550 aa  73.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  31.72 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  47.06 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.68 
 
 		 972 aa  70.5  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  39.25 
 
 		 990 aa  70.1  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  27.31 
 
 		 1782 aa  69.7  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  32.02 
 
 		 2363 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  34.33 
 
 		 1066 aa  68.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  22.59 
 
 		 4248 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.23 
 
 		 1134 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  31.98 
 
 		 994 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.44 
 
 		 1357 aa  67  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 		 1156 aa  64.7  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  35.06 
 
 		 1016 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  45.88 
 
 		 1172 aa  62.4  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  38.35 
 
 		 1129 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  38.35 
 
 		 1129 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  38.35 
 
 		 1131 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  38.35 
 
 		 1131 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  38.35 
 
 		 1131 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  38.35 
 
 		 1131 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  38.35 
 
 		 1131 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.79 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  25.76 
 
 		 3954 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  26.62 
 
 		 1012 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  35.51 
 
 		 1130 aa  57  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.28 
 
 		 2926 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2566  hypothetical protein  31.08 
 
 		 617 aa  57  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  35.09 
 
 		 942 aa  55.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1530 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  24.54 
 
 		 4238 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.85 
 
 		 3506 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  34.92 
 
 		 550 aa  55.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  25.74 
 
 		 3822 aa  54.7  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  24.54 
 
 		 4238 aa  54.7  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  32.91 
 
 		 985 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  21.81 
 
 		 2848 aa  50.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  32.41 
 
 		 1593 aa  48.9  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2839  outer membrane autotransporter  31.62 
 
 		 1105 aa  48.5  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  21.55 
 
 		 1369 aa  48.5  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  47.56 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.24 
 
 		 3629 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1325 aa  47  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  32.04 
 
 		 860 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  23.77 
 
 		 677 aa  45.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>