17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2839 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2839  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1105 aa  2198    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.17 
 
 		 1125 aa  53.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40 
 
 		 1081 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  36.67 
 
 		 1180 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.01 
 
 		 1154 aa  48.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  31.62 
 
 		 987 aa  48.5  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.93 
 
 		 1001 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  36.26 
 
 		 1055 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  52 
 
 		 1111 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  40.85 
 
 		 907 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.13 
 
 		 1134 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  34.29 
 
 		 1001 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  41.38 
 
 		 983 aa  46.2  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  28.32 
 
 		 882 aa  45.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.91 
 
 		 1532 aa  45.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  38.54 
 
 		 990 aa  45.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  41.25 
 
 		 1458 aa  45.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>