More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3667 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  100 
 
 		 311 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  92.88 
 
 		 313 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  87.95 
 
 		 317 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  84.79 
 
 		 314 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.57 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  69.4 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  64.94 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  61.51 
 
 		 326 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  60.71 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  61.59 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  61.59 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  58.9 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  59.41 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  60.52 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  61.31 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  59.8 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  61.06 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  60.86 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  61.81 
 
 		 331 aa  363  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  58.47 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  58.47 
 
 		 323 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  59.93 
 
 		 304 aa  361  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  60.2 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  61.56 
 
 		 316 aa  348  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  56.77 
 
 		 317 aa  345  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  60.07 
 
 		 302 aa  335  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  57.1 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  57.56 
 
 		 691 aa  309  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  45.83 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  47.33 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  47.33 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  47.3 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  46.46 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  46.46 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  46.46 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  46.46 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  49.17 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.52 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  47.56 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  47.02 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.7 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  45.79 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  45.34 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  46.25 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.23 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  44.44 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  42.62 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.98 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.81 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 340 aa  245  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.33 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 350 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  41.78 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.71 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40.91 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.91 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  42.61 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  52.86 
 
 		 512 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  51.97 
 
 		 510 aa  232  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  40.47 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.97 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  42.62 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  45.7 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  48.18 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.19 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  50 
 
 		 585 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  40.33 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  49.55 
 
 		 581 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.55 
 
 		 582 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  40 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  49.54 
 
 		 594 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  45.5 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  45.37 
 
 		 579 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  47.95 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 1171 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 578 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  41.1 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.26 
 
 		 247 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  47.37 
 
 		 576 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  49.33 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>