More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0548 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
268 aa  550  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  2.69933e-07 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  43.53 
 
 
254 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  3.19394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  44.39 
 
 
267 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.30567e-07  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  40.44 
 
 
272 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  40.81 
 
 
279 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  40.44 
 
 
272 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 
270 aa  185  7e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  44.74 
 
 
273 aa  184  1e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  41.53 
 
 
282 aa  179  3e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  40.97 
 
 
270 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  38.6 
 
 
271 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  40.68 
 
 
272 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
270 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  36.53 
 
 
267 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  39.74 
 
 
268 aa  172  4e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  37.55 
 
 
289 aa  172  6e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51059e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  40.97 
 
 
272 aa  172  6e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  35.02 
 
 
268 aa  171  8e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  38.11 
 
 
258 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  41.92 
 
 
273 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36.03 
 
 
274 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  42.17 
 
 
273 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  39.48 
 
 
273 aa  163  2e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  36.94 
 
 
271 aa  163  4e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  39.24 
 
 
302 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  35.37 
 
 
272 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  37.55 
 
 
305 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  35.93 
 
 
288 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  36.29 
 
 
291 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  38.53 
 
 
316 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.75761e-08 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 
311 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  35.34 
 
 
340 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  36.21 
 
 
284 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  36.4 
 
 
284 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
262 aa  148  1e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 
280 aa  148  1e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  32.64 
 
 
314 aa  147  2e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  37.75 
 
 
281 aa  146  4e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  37.28 
 
 
280 aa  145  7e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  35.53 
 
 
319 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  34.46 
 
 
265 aa  140  2e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 
285 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 
271 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  6.09738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  36.55 
 
 
248 aa  138  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.17052e-06  hitchhiker  6.5256e-06 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 
280 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 
314 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 
314 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.42 
 
 
266 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.04965e-06  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  39.33 
 
 
269 aa  134  2e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  41.28 
 
 
271 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 
404 aa  133  4e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  38.6 
 
 
262 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  33.09 
 
 
275 aa  131  1e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  36.61 
 
 
255 aa  131  1e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 
268 aa  130  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.10302e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 
272 aa  130  2e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  32.54 
 
 
266 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.70092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  32.31 
 
 
273 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  33.61 
 
 
275 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30.71 
 
 
266 aa  128  8e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
268 aa  128  8e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  127  2e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
265 aa  127  2e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  30.34 
 
 
268 aa  127  2e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  35.55 
 
 
274 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
269 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
269 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 
275 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
269 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  37.5 
 
 
266 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 
422 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  36.79 
 
 
277 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  30.38 
 
 
263 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  37.69 
 
 
264 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  31 
 
 
266 aa  121  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 
259 aa  121  1e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  37.36 
 
 
293 aa  120  2e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  36.81 
 
 
262 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  37.79 
 
 
263 aa  118  8e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
267 aa  118  1e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.74 
 
 
269 aa  117  2e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  35.12 
 
 
320 aa  117  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 
268 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  34.62 
 
 
270 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 
284 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
269 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.65758e-06  hitchhiker  2.97579e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
269 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
269 aa  115  7e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  35.85 
 
 
269 aa  115  9e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.46898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
349 aa  114  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  35.05 
 
 
270 aa  114  1e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.75 
 
 
278 aa  114  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  29.78 
 
 
350 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  36.26 
 
 
265 aa  114  2e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  29.78 
 
 
351 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  29.78 
 
 
344 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  29.78 
 
 
346 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  29.78 
 
 
347 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  29.78 
 
 
350 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  29.78 
 
 
347 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>