More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3050 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  100 
 
 
584 aa  1190  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  54.67 
 
 
588 aa  650  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  50.76 
 
 
587 aa  575  1e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  49.83 
 
 
582 aa  559  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  49.83 
 
 
583 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  48.14 
 
 
588 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  49.06 
 
 
587 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.33 
 
 
604 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  42.52 
 
 
599 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.05 
 
 
613 aa  332  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.07 
 
 
599 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.26 
 
 
614 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.96 
 
 
605 aa  329  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.73 
 
 
600 aa  317  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.44 
 
 
593 aa  310  6e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.92 
 
 
626 aa  308  1e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.21 
 
 
601 aa  308  2e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.11 
 
 
604 aa  306  9e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.92 
 
 
595 aa  305  1e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.43 
 
 
619 aa  305  1e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.51 
 
 
595 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.61 
 
 
595 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.53 
 
 
636 aa  300  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  40 
 
 
631 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  34.49 
 
 
599 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.32 
 
 
618 aa  297  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.58 
 
 
617 aa  290  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.53 
 
 
544 aa  290  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.06361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.39 
 
 
605 aa  288  3e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  33.02 
 
 
601 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.93 
 
 
600 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  35.27 
 
 
630 aa  286  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.63 
 
 
598 aa  285  1e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.63 
 
 
598 aa  285  1e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.71 
 
 
604 aa  285  1e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.63 
 
 
598 aa  285  2e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.63 
 
 
598 aa  285  2e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.63 
 
 
598 aa  285  2e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  34.8 
 
 
660 aa  285  2e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.63 
 
 
598 aa  283  4e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.39 
 
 
598 aa  283  4e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.66 
 
 
633 aa  284  4e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  33.81 
 
 
611 aa  283  5e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.39 
 
 
571 aa  283  5e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.39 
 
 
598 aa  283  6e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  37.96 
 
 
632 aa  283  7e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  34.84 
 
 
632 aa  283  8e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  34.48 
 
 
657 aa  282  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.03 
 
 
663 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  35.39 
 
 
662 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  38.61 
 
 
598 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.58 
 
 
601 aa  280  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  34 
 
 
652 aa  280  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.86 
 
 
623 aa  279  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  31.5 
 
 
596 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.78 
 
 
598 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.79 
 
 
664 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  31.02 
 
 
703 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.14 
 
 
598 aa  277  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.96 
 
 
660 aa  277  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.6 
 
 
651 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.6 
 
 
655 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.54 
 
 
605 aa  276  1e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.54 
 
 
605 aa  276  1e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.41 
 
 
660 aa  276  1e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  39.26 
 
 
631 aa  275  2e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.41 
 
 
660 aa  275  2e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.41 
 
 
660 aa  275  2e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  38.96 
 
 
626 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.17 
 
 
660 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  32.96 
 
 
656 aa  273  4e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.6 
 
 
640 aa  273  4e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.13 
 
 
652 aa  274  4e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.58 
 
 
663 aa  273  5e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  37 
 
 
623 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  36.9 
 
 
640 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.53 
 
 
645 aa  272  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.64 
 
 
638 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.19 
 
 
614 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  35.63 
 
 
673 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.46 
 
 
656 aa  271  3e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  36.41 
 
 
577 aa  271  3e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34.14 
 
 
578 aa  270  4e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  34.95 
 
 
571 aa  270  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.32 
 
 
613 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36 
 
 
579 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  31.31 
 
 
588 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.56 
 
 
639 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  37.65 
 
 
641 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  39.4 
 
 
629 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  34.23 
 
 
704 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3728  DNA primase  41.29 
 
 
471 aa  268  3e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  33.82 
 
 
565 aa  267  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.45 
 
 
617 aa  266  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.84 
 
 
676 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.05 
 
 
653 aa  266  9e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  38 
 
 
645 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  38.57 
 
 
658 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  30.36 
 
 
590 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.83 
 
 
590 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>