More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4182 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  93.27 
 
 		 431 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 431 aa  848    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  32.29 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  32.57 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  32.03 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  31.96 
 
 		 421 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  32.84 
 
 		 491 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  29.65 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  29.76 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  32.32 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  29.57 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  28.5 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  27.42 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  30.61 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 458 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.06 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  24.87 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  24.69 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  26.21 
 
 		 476 aa  93.2  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 463 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 517 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 489 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 441 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 473 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 473 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.21 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 1496 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  29.27 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 		 627 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 731 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  26.4 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 525 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  28.96 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.68 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  29.57 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  30.2 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  28.47 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.48 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>