More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3706 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 447 aa  887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  48.21 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  44.81 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  41.11 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  31.21 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  29.28 
 
 		 442 aa  186  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  30.68 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  30.27 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  30.26 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  28.51 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  28.8 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 455 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  27.25 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 443 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.48 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.47 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  23.96 
 
 		 456 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.65 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 535 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  21.73 
 
 		 1470 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.87 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 1496 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.91 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  22.6 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.29 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  22.22 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  20.78 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  22.25 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  21.26 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.47 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  22.92 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.14 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  22.85 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  22.85 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  22.85 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.1 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  23.66 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  23.66 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  23.66 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  23.66 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  22.65 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  20.59 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.44 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.19 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.1 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0733  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.42 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>