More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1901 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  47.32 
 
 		 1067 aa  1010    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  46.23 
 
 		 1062 aa  988    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  41.77 
 
 		 1111 aa  902    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  46.42 
 
 		 1071 aa  1011    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  45.99 
 
 		 1049 aa  991    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  46.75 
 
 		 1069 aa  1025    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  45.12 
 
 		 1062 aa  995    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  45.12 
 
 		 1062 aa  997    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  100 
 
 		 1084 aa  2239    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  48.08 
 
 		 1066 aa  1014    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  44.93 
 
 		 1062 aa  991    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  47.31 
 
 		 1065 aa  1001    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  44.18 
 
 		 1062 aa  976    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  42.07 
 
 		 1078 aa  888    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  46.8 
 
 		 1138 aa  1081    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  42.37 
 
 		 1113 aa  914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  44.6 
 
 		 1062 aa  982    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  44.51 
 
 		 1062 aa  980    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  48.28 
 
 		 1060 aa  1025    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  46.52 
 
 		 1081 aa  1014    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  42.37 
 
 		 1062 aa  899    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  44.41 
 
 		 1062 aa  977    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  45.02 
 
 		 598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  31.54 
 
 		 1052 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  45.39 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  23.84 
 
 		 1042 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.84 
 
 		 1040 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.77 
 
 		 1059 aa  199  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1042 aa  194  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1031 aa  192  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.65 
 
 		 1005 aa  191  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  22.82 
 
 		 1014 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  22.23 
 
 		 1010 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  26.82 
 
 		 568 aa  121  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  29.63 
 
 		 441 aa  118  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.89 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  26.77 
 
 		 490 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 666 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.15 
 
 		 426 aa  108  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  28.17 
 
 		 483 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  26.62 
 
 		 451 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  23.28 
 
 		 686 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.41 
 
 		 423 aa  101  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  24.88 
 
 		 430 aa  101  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.29 
 
 		 407 aa  100  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25.74 
 
 		 421 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.31 
 
 		 433 aa  99.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  25.67 
 
 		 529 aa  97.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.29 
 
 		 496 aa  97.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.79 
 
 		 430 aa  96.3  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.6 
 
 		 444 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  23.84 
 
 		 431 aa  95.9  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.18 
 
 		 440 aa  94.7  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  22.78 
 
 		 438 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  26.42 
 
 		 435 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.19 
 
 		 478 aa  93.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.12 
 
 		 438 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.31 
 
 		 383 aa  92  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.92 
 
 		 426 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  24.72 
 
 		 585 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  24.42 
 
 		 456 aa  90.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.49 
 
 		 434 aa  89.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.06 
 
 		 432 aa  89  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  26.67 
 
 		 413 aa  88.2  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.65 
 
 		 459 aa  87  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  22.89 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.46 
 
 		 401 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.98 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  26.15 
 
 		 470 aa  87  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  24.81 
 
 		 1097 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  23.76 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  24.65 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  25.38 
 
 		 702 aa  85.5  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  24.09 
 
 		 445 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  23.25 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  23.81 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.37 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.48 
 
 		 680 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  22.8 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  21.51 
 
 		 672 aa  81.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  25.5 
 
 		 412 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.74 
 
 		 407 aa  80.9  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.18 
 
 		 419 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  27.27 
 
 		 411 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  23.6 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  23.56 
 
 		 1067 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  23.56 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.49 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  23.47 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.34 
 
 		 434 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  24.19 
 
 		 413 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.01 
 
 		 1090 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.4 
 
 		 692 aa  77.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  26.91 
 
 		 416 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.84 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  23.98 
 
 		 433 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  23.19 
 
 		 1082 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  36.79 
 
 		 470 aa  77  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  34.34 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  24.57 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>