More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2016 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 378 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  58.75 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 421 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  31.59 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  32.36 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.3 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 374 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.58 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  29.4 
 
 		 802 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 		 801 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  26.92 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 752 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  26.76 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  26.41 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 637 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.3 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.13 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 1101 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.08 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  27.08 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.08 
 
 		 441 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 441 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.08 
 
 		 441 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.08 
 
 		 441 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.08 
 
 		 441 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.96 
 
 		 1099 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 1124 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  30 
 
 		 694 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.3 
 
 		 927 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.3 
 
 		 1115 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.3 
 
 		 1119 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.85 
 
 		 1115 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.09 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 1115 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.3 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.51 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  28.91 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  26.04 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  26.04 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  26.04 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  28 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 		 1154 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 1115 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  29.76 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.92 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 1118 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 1002 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.07 
 
 		 442 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25.37 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  27.66 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  27.66 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  26.19 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>