163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0037 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0032  hypothetical protein  92.43 
 
 		 434 aa  825    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  892    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4109  hypothetical protein  69.98 
 
 		 427 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3923  hypothetical protein  68.79 
 
 		 427 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0046  hypothetical protein  69.45 
 
 		 426 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0009  hypothetical protein  66.67 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4201  putative ATP/GTP-binding protein  62.68 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4039  putative cytoplasmic protein  61.87 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0014  conserved hypothetical protein  60.93 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0014  hypothetical protein  60.93 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03572  hypothetical protein  60.93 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03516  hypothetical protein  60.93 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3901  hypothetical protein  60.69 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4198  hypothetical protein  60.93 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4054  hypothetical protein  60.44 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0011  putative ATP/GTP-binding protein  58.61 
 
 		 408 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5122  hypothetical protein  59.46 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.116872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4230  hypothetical protein  62.28 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4309  hypothetical protein  37.3 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0549386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.19 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.65 
 
 		 692 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  37.29 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  35.07 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.04 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.62 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  31.86 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.07 
 
 		 660 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.41 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  33.96 
 
 		 774 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 567 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1005 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  35.92 
 
 		 674 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.48 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.92 
 
 		 674 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.48 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.43 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.04 
 
 		 682 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.76 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.33 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.93 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.17 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  32.87 
 
 		 717 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  50.91 
 
 		 673 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  30.6 
 
 		 982 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.66 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.72 
 
 		 708 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.09 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.57 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  27.59 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 642 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.8 
 
 		 674 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  34.43 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  30.23 
 
 		 1097 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.1 
 
 		 605 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.09 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  30.58 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.43 
 
 		 670 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  31.36 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.79 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 888 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  30 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  30.33 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.69 
 
 		 610 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.48 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.31 
 
 		 695 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  30 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.29 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  33.93 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  34.91 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.41 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  34.91 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.58 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  30 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.43 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.29 
 
 		 594 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.43 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  29.66 
 
 		 1062 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1081 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  31.31 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.57 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.99 
 
 		 720 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1510 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.19 
 
 		 1052 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  29.09 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.51 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 		 1481 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1069 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.11 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  32 
 
 		 1125 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>