90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4109 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0032  hypothetical protein  70.99 
 
 		 434 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4109  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  880    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3923  hypothetical protein  80.09 
 
 		 427 aa  719    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0037  hypothetical protein  69.98 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0046  hypothetical protein  68.63 
 
 		 426 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0009  hypothetical protein  70.48 
 
 		 433 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4201  putative ATP/GTP-binding protein  61 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4039  putative cytoplasmic protein  60.77 
 
 		 408 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4198  hypothetical protein  61.03 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03516  hypothetical protein  61.03 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03572  hypothetical protein  61.03 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0014  conserved hypothetical protein  60.54 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3901  hypothetical protein  60.78 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0014  hypothetical protein  60.54 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4054  hypothetical protein  60.29 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0011  putative ATP/GTP-binding protein  58.71 
 
 		 408 aa  492  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5122  hypothetical protein  59.07 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.116872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4230  hypothetical protein  61.19 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4309  hypothetical protein  35.99 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0549386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.19 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.75 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  35.04 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  35 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  35 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  35 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.2 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  27.85 
 
 		 1010 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  32.86 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.11 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 		 708 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  35.51 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.84 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.33 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2690  hypothetical protein  30.89 
 
 		 527 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.72 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.67 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  49.09 
 
 		 673 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  28.81 
 
 		 1062 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  27.05 
 
 		 1060 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.58 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.78 
 
 		 642 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.54 
 
 		 656 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  30.58 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.11 
 
 		 751 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.68 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  28.81 
 
 		 1062 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.51 
 
 		 682 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.19 
 
 		 1028 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  30.58 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  28.81 
 
 		 1062 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  28.81 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1021 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.54 
 
 		 1059 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.91 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  28.81 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.81 
 
 		 1062 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  28.57 
 
 		 1138 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  30.46 
 
 		 1014 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.67 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  27.12 
 
 		 698 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  30.08 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1066 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.42 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.42 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  30 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  26.36 
 
 		 1069 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.61 
 
 		 692 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.95 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.05 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  32.79 
 
 		 1097 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  38.46 
 
 		 1078 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.28 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1081 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  34.95 
 
 		 1016 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.28 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  27.97 
 
 		 1062 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  43.64 
 
 		 774 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  27.12 
 
 		 1062 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  33.88 
 
 		 674 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>