262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1536 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  70.28 
 
 		 215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 324 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  34.29 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  25.19 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25.69 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 420 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>