More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1941 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.69 
 
 		 1117 aa  640    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  39.25 
 
 		 998 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  54 
 
 		 1429 aa  1552    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.46 
 
 		 1035 aa  730    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  40.19 
 
 		 1329 aa  922    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.47 
 
 		 1440 aa  1637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  53.11 
 
 		 1432 aa  1539    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.54 
 
 		 1440 aa  1638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  61.13 
 
 		 1472 aa  1839    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  100 
 
 		 1450 aa  2992    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  39.52 
 
 		 1328 aa  898    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  56.02 
 
 		 1441 aa  1618    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.9 
 
 		 1124 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.85 
 
 		 1176 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.51 
 
 		 1025 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.13 
 
 		 2156 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  34.18 
 
 		 1942 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.78 
 
 		 891 aa  539  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  40.14 
 
 		 717 aa  512  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.82 
 
 		 1331 aa  512  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.67 
 
 		 946 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.4 
 
 		 1975 aa  503  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.23 
 
 		 991 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  37.79 
 
 		 1062 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.07 
 
 		 1891 aa  469  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.88 
 
 		 1855 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.87 
 
 		 1248 aa  463  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.68 
 
 		 2068 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  27.72 
 
 		 1136 aa  303  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  28.59 
 
 		 850 aa  274  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  28.52 
 
 		 852 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.46 
 
 		 1043 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.16 
 
 		 852 aa  273  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  28.64 
 
 		 852 aa  273  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  28.64 
 
 		 852 aa  273  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  30.36 
 
 		 848 aa  272  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  29.08 
 
 		 843 aa  268  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  29.02 
 
 		 843 aa  266  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.47 
 
 		 842 aa  262  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  29.94 
 
 		 848 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  28.97 
 
 		 852 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  30.67 
 
 		 856 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.97 
 
 		 899 aa  254  7e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.59 
 
 		 655 aa  250  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  27.12 
 
 		 655 aa  250  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  29.93 
 
 		 852 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  29.73 
 
 		 647 aa  246  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  27.82 
 
 		 1064 aa  245  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  27.39 
 
 		 1064 aa  242  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.73 
 
 		 1888 aa  239  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  29.27 
 
 		 841 aa  231  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.14 
 
 		 825 aa  230  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.41 
 
 		 718 aa  229  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  27.9 
 
 		 874 aa  229  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  30.07 
 
 		 601 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  28.2 
 
 		 928 aa  218  9e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  25 
 
 		 713 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  25 
 
 		 713 aa  215  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  25.44 
 
 		 713 aa  215  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.87 
 
 		 713 aa  215  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  25 
 
 		 713 aa  214  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  25 
 
 		 713 aa  214  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  25.75 
 
 		 713 aa  214  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  24.86 
 
 		 713 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  25.61 
 
 		 713 aa  213  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.44 
 
 		 713 aa  208  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.3 
 
 		 2638 aa  206  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  26.79 
 
 		 712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  28.67 
 
 		 766 aa  196  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.15 
 
 		 669 aa  192  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.38 
 
 		 640 aa  191  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.93 
 
 		 640 aa  189  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  25.89 
 
 		 1252 aa  148  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  22.98 
 
 		 776 aa  140  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  24.2 
 
 		 817 aa  105  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  25.36 
 
 		 701 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  22.19 
 
 		 714 aa  95.1  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  21.99 
 
 		 707 aa  90.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  21.73 
 
 		 706 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2272  type II secretory pathway protein  29.45 
 
 		 496 aa  89.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  22.07 
 
 		 1537 aa  89  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  23.29 
 
 		 721 aa  88.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  22.99 
 
 		 720 aa  88.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  22.81 
 
 		 727 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  26.57 
 
 		 1464 aa  85.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  23.3 
 
 		 694 aa  85.1  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  22.79 
 
 		 830 aa  85.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09570  glycogen debranching enzyme GlgX  28.62 
 
 		 732 aa  85.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213931  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  22.66 
 
 		 717 aa  85.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  24.22 
 
 		 701 aa  84.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  24.57 
 
 		 711 aa  84.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  25.29 
 
 		 701 aa  84.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  25.18 
 
 		 716 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  26.49 
 
 		 704 aa  84  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  22.87 
 
 		 802 aa  84.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  22.17 
 
 		 709 aa  84  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  26.05 
 
 		 779 aa  82.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  23.73 
 
 		 718 aa  82.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  22.93 
 
 		 721 aa  83.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  22.11 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>