More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13383 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_13383  predicted protein  100 
 
 
164 aa  327  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12620  predicted protein  56.89 
 
 
532 aa  184  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  55.69 
 
 
844 aa  184  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_3366  predicted protein  53.61 
 
 
225 aa  179  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.851714  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  51.5 
 
 
794 aa  172  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41487  predicted protein  51.81 
 
 
550 aa  173  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00314101  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30476  predicted protein  52.33 
 
 
737 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.59852  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  45.28 
 
 
810 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42768  predicted protein  45.95 
 
 
599 aa  142  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.22 
 
 
768 aa  140  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  46.2 
 
 
405 aa  140  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.59 
 
 
769 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.34 
 
 
400 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  44.72 
 
 
436 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  44.1 
 
 
410 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.57 
 
 
808 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.48 
 
 
754 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  44.65 
 
 
393 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  44.65 
 
 
379 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  44.3 
 
 
404 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  44.03 
 
 
404 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  49.69 
 
 
703 aa  134  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  44.03 
 
 
405 aa  134  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.99 
 
 
757 aa  134  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12252  predicted protein  74.44 
 
 
131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  47.13 
 
 
741 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.39 
 
 
719 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  47.13 
 
 
741 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  47.13 
 
 
741 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.05 
 
 
727 aa  134  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.4 
 
 
759 aa  134  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.72 
 
 
718 aa  134  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  46.25 
 
 
750 aa  134  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  47.5 
 
 
734 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  43.04 
 
 
390 aa  133  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  44.94 
 
 
393 aa  133  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.2 
 
 
735 aa  133  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 
801 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  43.56 
 
 
412 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.95 
 
 
760 aa  133  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.03 
 
 
852 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.44 
 
 
806 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  44.65 
 
 
412 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1916  AAA ATPase central domain protein  43.43 
 
 
583 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000404322 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.08 
 
 
713 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45 
 
 
739 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.14 
 
 
754 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  43.4 
 
 
403 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2173  vesicle-fusing ATPase  44.19 
 
 
594 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0532603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.9 
 
 
732 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2004  AAA ATPase central domain protein  43.68 
 
 
544 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  45.06 
 
 
742 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  47.1 
 
 
699 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.72 
 
 
738 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  43.48 
 
 
810 aa  131  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.56 
 
 
773 aa  131  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.5 
 
 
754 aa  131  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  41.71 
 
 
592 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  44.03 
 
 
410 aa  130  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.72 
 
 
737 aa  130  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.1 
 
 
737 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  43.4 
 
 
405 aa  130  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  42.77 
 
 
829 aa  130  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  42.94 
 
 
406 aa  130  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2242  AAA ATPase central domain protein  40.98 
 
 
560 aa  130  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.67 
 
 
740 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.5 
 
 
763 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.17 
 
 
709 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  44.38 
 
 
728 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.1 
 
 
731 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  45.06 
 
 
748 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  46.25 
 
 
747 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  43.56 
 
 
814 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  43.21 
 
 
737 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  41.81 
 
 
615 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.03 
 
 
781 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  44.65 
 
 
739 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  41.1 
 
 
450 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  41.71 
 
 
593 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  41.36 
 
 
386 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.3 
 
 
805 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  44.65 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  43.4 
 
 
389 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  41.81 
 
 
615 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  43.83 
 
 
729 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.5 
 
 
736 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  41.81 
 
 
615 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3458  vesicle-fusing ATPase  41.81 
 
 
615 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  42.14 
 
 
407 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.14 
 
 
731 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  41.81 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.4 
 
 
800 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.4 
 
 
784 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22080  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  41.71 
 
 
602 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  41.46 
 
 
413 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  45.96 
 
 
749 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.72 
 
 
738 aa  128  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4882  ATPase central domain-containing protein  40.11 
 
 
601 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000159946  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  42.86 
 
 
421 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  41.51 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>