More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12252 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12252  predicted protein  100 
 
 		 131 aa  257  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13383  predicted protein  74.44 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41487  predicted protein  49.25 
 
 		 550 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00314101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  47.01 
 
 		 794 aa  126  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  48.12 
 
 		 844 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12620  predicted protein  46.67 
 
 		 532 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30476  predicted protein  50.38 
 
 		 737 aa  124  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.59852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_3366  predicted protein  51.75 
 
 		 225 aa  115  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.851714  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03098  vesicular fusion ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12510)  54.21 
 
 		 775 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  47.69 
 
 		 703 aa  103  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  44.96 
 
 		 810 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 641 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  41.98 
 
 		 626 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 641 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  44.53 
 
 		 699 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.54 
 
 		 673 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  42.96 
 
 		 584 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  42.75 
 
 		 393 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  42.52 
 
 		 379 aa  99  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  42.75 
 
 		 627 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  41.73 
 
 		 645 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.98 
 
 		 631 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  42.22 
 
 		 584 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.46 
 
 		 621 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  43.18 
 
 		 410 aa  98.2  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.75 
 
 		 649 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  41.98 
 
 		 628 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  41.79 
 
 		 577 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.98 
 
 		 628 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.98 
 
 		 628 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  42.22 
 
 		 584 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  41.22 
 
 		 410 aa  97.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.02 
 
 		 662 aa  97.1  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.28 
 
 		 637 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.17 
 
 		 629 aa  96.7  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  42.54 
 
 		 639 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.69 
 
 		 621 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.88 
 
 		 655 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  43.51 
 
 		 619 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  40.77 
 
 		 829 aa  96.3  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.45 
 
 		 650 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.46 
 
 		 636 aa  96.3  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  43.17 
 
 		 629 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.17 
 
 		 656 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 631 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 631 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.01 
 
 		 651 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  41.22 
 
 		 632 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.04 
 
 		 653 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  38.93 
 
 		 647 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.48 
 
 		 584 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.75 
 
 		 652 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.29 
 
 		 644 aa  95.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 627 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  42.06 
 
 		 660 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.17 
 
 		 657 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 631 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 631 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 631 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 629 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 649 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.27 
 
 		 808 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.28 
 
 		 663 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.06 
 
 		 635 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  41.22 
 
 		 628 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  42.06 
 
 		 658 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.48 
 
 		 768 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.94 
 
 		 769 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  41.61 
 
 		 663 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  40.29 
 
 		 638 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.45 
 
 		 660 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.04 
 
 		 650 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  41.27 
 
 		 639 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  41.27 
 
 		 639 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 627 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.45 
 
 		 659 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.85 
 
 		 598 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.28 
 
 		 651 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.23 
 
 		 657 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  43.17 
 
 		 659 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.01 
 
 		 646 aa  94.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 		 656 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.29 
 
 		 647 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.08 
 
 		 773 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.31 
 
 		 671 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  40.48 
 
 		 650 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.29 
 
 		 647 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  46.56 
 
 		 763 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.06 
 
 		 641 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.57 
 
 		 652 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  40.29 
 
 		 764 aa  94.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>