More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30898 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  100 
 
 
422 aa  865    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  53.78 
 
 
434 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  52.34 
 
 
433 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  52.13 
 
 
439 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  49.66 
 
 
442 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03691  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12560)  44.2 
 
 
803 aa  247  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  42.99 
 
 
810 aa  233  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_6399  predicted protein  43.88 
 
 
290 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458224  normal  0.109876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
367 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_2208  predicted protein  41.53 
 
 
303 aa  206  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  31.62 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.62 
 
 
736 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.43 
 
 
727 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  32.85 
 
 
369 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.44 
 
 
732 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.42 
 
 
759 aa  186  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.16 
 
 
735 aa  186  9e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.62 
 
 
723 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.61 
 
 
731 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.31 
 
 
731 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.89 
 
 
731 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.86 
 
 
852 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.79 
 
 
718 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.48 
 
 
760 aa  183  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.61 
 
 
731 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.06 
 
 
769 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.75 
 
 
704 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.37 
 
 
768 aa  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.92 
 
 
737 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.15 
 
 
808 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  40.77 
 
 
464 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  40.57 
 
 
713 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.19 
 
 
736 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.79 
 
 
806 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.65 
 
 
755 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.34 
 
 
721 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.63 
 
 
709 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.19 
 
 
719 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  34.41 
 
 
804 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.02 
 
 
701 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.36 
 
 
754 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30513  predicted protein  42.21 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.436051  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
810 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.81 
 
 
739 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.59 
 
 
756 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.34 
 
 
754 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.59 
 
 
737 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.65 
 
 
757 aa  173  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.12 
 
 
763 aa  173  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.59 
 
 
738 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.79 
 
 
740 aa  172  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  36.83 
 
 
703 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.97 
 
 
754 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  35.83 
 
 
763 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  35.87 
 
 
764 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.92 
 
 
754 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.67 
 
 
742 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  40.34 
 
 
722 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.02 
 
 
715 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  34.33 
 
 
814 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.08 
 
 
810 aa  170  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.56 
 
 
738 aa  170  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.42 
 
 
805 aa  170  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  38.56 
 
 
866 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  35 
 
 
829 aa  169  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.33 
 
 
754 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.34 
 
 
757 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.62 
 
 
740 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  39.23 
 
 
703 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  33.23 
 
 
337 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  39.75 
 
 
405 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.36 
 
 
743 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  41 
 
 
776 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.77 
 
 
757 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  42.44 
 
 
775 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.06 
 
 
800 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  34.03 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  33.65 
 
 
718 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.36 
 
 
742 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.39 
 
 
753 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  41.53 
 
 
370 aa  166  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  39.21 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  38.24 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.84 
 
 
781 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.45 
 
 
805 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  40.51 
 
 
410 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.55 
 
 
801 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.06 
 
 
781 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  37.78 
 
 
407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  40.08 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  38.15 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  42.26 
 
 
732 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  40 
 
 
699 aa  163  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.38 
 
 
804 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  40.97 
 
 
607 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.96 
 
 
772 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  39.21 
 
 
473 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.82 
 
 
784 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  37.78 
 
 
407 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  38.46 
 
 
639 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>