More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29260 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  50.52 
 
 		 684 aa  678    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.54 
 
 		 653 aa  636    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  51.58 
 
 		 669 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  52.11 
 
 		 670 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  51.36 
 
 		 670 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  51.4 
 
 		 687 aa  698    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  51.65 
 
 		 670 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.26 
 
 		 670 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  51.88 
 
 		 669 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.33 
 
 		 669 aa  678    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67105  transketolase 1  51.95 
 
 		 677 aa  683    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.83 
 
 		 668 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.72 
 
 		 668 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.2 
 
 		 669 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29260  transketolase  100 
 
 		 684 aa  1427    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.029788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  52.87 
 
 		 668 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  51.28 
 
 		 668 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.23 
 
 		 668 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.54 
 
 		 672 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  52.11 
 
 		 670 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  51.13 
 
 		 668 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  52.1 
 
 		 670 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  51.51 
 
 		 669 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  49.55 
 
 		 682 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  46.77 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  47.7 
 
 		 674 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  47.3 
 
 		 662 aa  619  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  46.17 
 
 		 666 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  47.07 
 
 		 668 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  47.58 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  45.71 
 
 		 680 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.71 
 
 		 680 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  45.71 
 
 		 666 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  45.86 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  45.71 
 
 		 666 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  45.86 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  46.8 
 
 		 671 aa  611  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  48.04 
 
 		 667 aa  609  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  47.96 
 
 		 678 aa  611  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  45.56 
 
 		 666 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  47.52 
 
 		 684 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  47.91 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  45.56 
 
 		 666 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.14 
 
 		 666 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.14 
 
 		 666 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  47 
 
 		 668 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  47.52 
 
 		 665 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  45.56 
 
 		 666 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  46.92 
 
 		 681 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  46.11 
 
 		 668 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  45.43 
 
 		 668 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  47.01 
 
 		 666 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  45.41 
 
 		 676 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  45.41 
 
 		 676 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  45.28 
 
 		 660 aa  595  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  47.29 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  47.09 
 
 		 697 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  46.75 
 
 		 659 aa  588  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  47.09 
 
 		 664 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  47.09 
 
 		 664 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  48.28 
 
 		 661 aa  592  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  46.75 
 
 		 659 aa  591  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  47.58 
 
 		 655 aa  590  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  47.39 
 
 		 664 aa  591  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  47.39 
 
 		 664 aa  592  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  48.87 
 
 		 666 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  46.94 
 
 		 664 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  46.8 
 
 		 664 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  46.19 
 
 		 664 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  46.94 
 
 		 664 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  46.75 
 
 		 665 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  46.46 
 
 		 665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  46.48 
 
 		 665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  46.79 
 
 		 664 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  46.54 
 
 		 663 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  45.89 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  47.24 
 
 		 675 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.49 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.3 
 
 		 666 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  45.67 
 
 		 711 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  45.85 
 
 		 663 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  45.7 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  45.7 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  45.85 
 
 		 663 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  46.19 
 
 		 663 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  45.85 
 
 		 663 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  45.23 
 
 		 660 aa  582  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  46.52 
 
 		 680 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  46.04 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  45.7 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  46.04 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  46.04 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  47.74 
 
 		 666 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  45.7 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  46.6 
 
 		 723 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  45.7 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  46.04 
 
 		 663 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  45.12 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  45.55 
 
 		 663 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  44.43 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>