More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28711 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  56 
 
 
706 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  59.68 
 
 
462 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  55.38 
 
 
706 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  60.13 
 
 
306 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  57.62 
 
 
582 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  61.18 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  53.97 
 
 
581 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  55.23 
 
 
539 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  45.63 
 
 
404 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43 
 
 
542 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  47.44 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.24 
 
 
406 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.24 
 
 
406 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  70 
 
 
233 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  44.85 
 
 
428 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
446 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  41.75 
 
 
308 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 
361 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 
605 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.34 
 
 
471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  43.45 
 
 
442 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 
649 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  46.24 
 
 
617 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.73 
 
 
357 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.4 
 
 
373 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  40.67 
 
 
371 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  44.36 
 
 
547 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  37.81 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
1022 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.23 
 
 
458 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 
1421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
1276 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.58 
 
 
1694 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.01 
 
 
1056 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.78 
 
 
988 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 
515 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.6 
 
 
818 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.07 
 
 
746 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
392 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.87 
 
 
784 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.7 
 
 
632 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.1 
 
 
738 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  39.16 
 
 
356 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  43.02 
 
 
878 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
927 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.69 
 
 
1056 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  43.03 
 
 
425 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.96 
 
 
810 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 
349 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.61 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  39.63 
 
 
750 aa  172  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  43.61 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
284 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.01 
 
 
778 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.01 
 
 
343 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  39.32 
 
 
4489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  73.2 
 
 
164 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 
243 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  45.63 
 
 
280 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  46.92 
 
 
271 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
3560 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
1192 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
543 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  41.15 
 
 
909 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
750 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
306 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 
685 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
3035 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
422 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  38.39 
 
 
820 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
1094 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.04 
 
 
248 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 
1827 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
804 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 
681 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  37.08 
 
 
1007 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
687 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.82 
 
 
725 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 
297 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
1276 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  37.83 
 
 
573 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
450 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
512 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.52 
 
 
1240 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 
543 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.94 
 
 
839 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.09 
 
 
707 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
465 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
318 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  52.48 
 
 
202 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 
593 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  44.81 
 
 
280 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
376 aa  142  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
4079 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
750 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 
3145 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
279 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>