More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
202 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  56.64 
 
 
539 aa  167  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  57.82 
 
 
306 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  57.69 
 
 
582 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  56.2 
 
 
462 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  51.43 
 
 
706 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  52.55 
 
 
706 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  52.9 
 
 
334 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  52.32 
 
 
233 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  40.19 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  40.43 
 
 
581 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  47.26 
 
 
404 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  51.59 
 
 
306 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  41.88 
 
 
331 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  45.99 
 
 
442 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.86 
 
 
542 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.38 
 
 
406 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.38 
 
 
406 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
178 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.11 
 
 
308 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.33 
 
 
471 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 
280 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  52.38 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  41.78 
 
 
308 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  43.26 
 
 
605 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 
243 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 
361 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
556 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
186 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 
280 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.85 
 
 
1022 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
428 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.95 
 
 
185 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  38.46 
 
 
248 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
446 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.81 
 
 
750 aa  99.4  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.2 
 
 
248 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.04 
 
 
357 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
297 aa  98.2  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 
373 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  44.14 
 
 
541 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
371 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 
391 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.75 
 
 
784 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.56 
 
 
818 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.46 
 
 
261 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  51 
 
 
547 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 
260 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.97 
 
 
1240 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.68 
 
 
988 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 
187 aa  91.7  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.62 
 
 
1056 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.69 
 
 
1056 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
1827 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 
352 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
1421 aa  89.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 
392 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
617 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
649 aa  88.6  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 
732 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.06 
 
 
249 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.06 
 
 
249 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  38.79 
 
 
250 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
422 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.9 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.88 
 
 
746 aa  85.1  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
166 aa  85.1  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  36.08 
 
 
390 aa  84.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.42 
 
 
778 aa  84.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.44 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
515 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.5 
 
 
820 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3682  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.17 
 
 
738 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
731 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  39.67 
 
 
415 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
927 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
356 aa  81.3  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.32 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.59 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
593 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
1276 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
615 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
349 aa  79  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 
410 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
425 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>