96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4599 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  35.56 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  29.5 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.95 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  30.37 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  30.43 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.05 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  26.9 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  29.08 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  35.42 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  29.73 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  25.53 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  27.54 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  26.06 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  29.29 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  26.53 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  36.05 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  28.78 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  38.82 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  37.78 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  26.92 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  30.33 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  38.82 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  31.06 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27 
 
 		 1372 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  26.24 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  27.59 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.77 
 
 		 1345 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.87 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  38.1 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  26.77 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  26.15 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  26.15 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  26.15 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  27.66 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  30.16 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  22.54 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  34.94 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  24.82 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  26.43 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  30.58 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  33.06 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  22.97 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  23.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  27.27 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  26.52 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  26.21 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  28.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  22.76 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.55 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  28.86 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  24.31 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  39.58 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  26.53 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  26.15 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  25.47 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  36.9 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  25.71 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  34.88 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  24.48 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  25.9 
 
 		 298 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  23.74 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  25.9 
 
 		 298 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  26.56 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  26.85 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  26.24 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  23.65 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  25.32 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  19.23 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  26.21 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1788  hypothetical protein  27.33 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  40.48 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  21.21 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  27.91 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  25.87 
 
 		 171 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  25.98 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  26.87 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  29.76 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  25.83 
 
 		 297 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  30.53 
 
 		 253 aa  41.2  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  31.76 
 
 		 234 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1717  hypothetical protein  27.21 
 
 		 295 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  27.88 
 
 		 241 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  25.18 
 
 		 298 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  35.63 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>