169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1218 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  31.33 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  32.76 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.04 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.4 
 
 		 178 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  29.67 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  41.79 
 
 		 191 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  38.58 
 
 		 190 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  38.58 
 
 		 190 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  28.44 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  31.18 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.48 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  30.36 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.83 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.15 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  30.29 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  29.63 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  35.37 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.57 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.06 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  34.72 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.24 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  34.72 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  30.81 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  34.65 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  35.25 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  28.78 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  33.55 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  32.43 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.26 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  36.57 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  27.54 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.26 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  28.23 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  35.56 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  29.21 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  29.21 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  37.5 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  28.47 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  36.09 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  36.97 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.72 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  36.5 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.47 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.23 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  34.48 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32.28 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32.28 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  36.11 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  36.11 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.14 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.56 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  26.19 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.08 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.08 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  36.13 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.08 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  35.51 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.65 
 
 		 164 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.82 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  32.81 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.09 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.38 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  29.25 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  43.94 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  33.33 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.62 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  36.09 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.39 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  34.46 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.69 
 
 		 187 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  34.15 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  33.86 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  26.72 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.07 
 
 		 171 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.82 
 
 		 214 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  26.97 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  36 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  29.46 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.63 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.55 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.46 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.91 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.97 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  25.83 
 
 		 175 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  37.74 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.77 
 
 		 184 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.49 
 
 		 175 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>