More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0011 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.24 
 
 
715 aa  708  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.77 
 
 
804 aa  661  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.19 
 
 
736 aa  697  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.4 
 
 
738 aa  739  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.86 
 
 
737 aa  704  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.96 
 
 
781 aa  749  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.55 
 
 
773 aa  664  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.82 
 
 
742 aa  729  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.56 
 
 
754 aa  712  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.92 
 
 
731 aa  715  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.94 
 
 
772 aa  671  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  51.87 
 
 
718 aa  718  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.22 
 
 
701 aa  727  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.09 
 
 
743 aa  736  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.25 
 
 
760 aa  670  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.31 
 
 
768 aa  722  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.43 
 
 
709 aa  705  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.65 
 
 
730 aa  639  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.45 
 
 
757 aa  740  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.31 
 
 
739 aa  702  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.69 
 
 
719 aa  833  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.43 
 
 
721 aa  726  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.32 
 
 
740 aa  723  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 
757 aa  682  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.52 
 
 
810 aa  679  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  50.61 
 
 
810 aa  713  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.56 
 
 
731 aa  712  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 
736 aa  718  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.32 
 
 
805 aa  707  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.45 
 
 
808 aa  758  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.2 
 
 
784 aa  736  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  50.74 
 
 
732 aa  689  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.01 
 
 
756 aa  723  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.68 
 
 
740 aa  724  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.61 
 
 
704 aa  676  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.58 
 
 
754 aa  731  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.69 
 
 
732 aa  784  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.26 
 
 
718 aa  762  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.65 
 
 
738 aa  691  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.85 
 
 
731 aa  710  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.2 
 
 
806 aa  741  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.44 
 
 
737 aa  693  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.08 
 
 
742 aa  722  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.16 
 
 
754 aa  717  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  100 
 
 
713 aa  1434  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.22 
 
 
763 aa  695  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.6 
 
 
723 aa  776  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.53 
 
 
800 aa  654  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.44 
 
 
757 aa  679  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.83 
 
 
755 aa  655  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.41 
 
 
753 aa  747  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.25 
 
 
754 aa  746  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.84 
 
 
781 aa  738  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.58 
 
 
805 aa  679  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  47.57 
 
 
721 aa  649  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.86 
 
 
735 aa  694  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  53.32 
 
 
722 aa  767  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.38 
 
 
769 aa  708  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  49.86 
 
 
764 aa  716  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.92 
 
 
731 aa  714  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.26 
 
 
852 aa  648  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.86 
 
 
801 aa  667  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  48.64 
 
 
763 aa  703  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  47.93 
 
 
775 aa  697  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.89 
 
 
759 aa  706  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  59.01 
 
 
727 aa  839  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.04 
 
 
738 aa  712  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  54.58 
 
 
754 aa  766  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.3 
 
 
801 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  46.86 
 
 
804 aa  623  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  46.33 
 
 
826 aa  622  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  48.81 
 
 
829 aa  605  1e-172  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  47.31 
 
 
810 aa  606  1e-172  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  49.15 
 
 
814 aa  604  1e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  46.32 
 
 
699 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  45.41 
 
 
703 aa  592  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  46.87 
 
 
806 aa  587  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  43.9 
 
 
739 aa  585  1e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  41.7 
 
 
703 aa  567  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  44.79 
 
 
746 aa  567  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  42.37 
 
 
776 aa  563  1e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  48.63 
 
 
647 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  45.02 
 
 
685 aa  535  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  46.55 
 
 
639 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  49.24 
 
 
601 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  50.97 
 
 
930 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  48.16 
 
 
613 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  47.86 
 
 
803 aa  499  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  48.92 
 
 
788 aa  486  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  46.18 
 
 
550 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  44.64 
 
 
691 aa  472  1e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  45.29 
 
 
567 aa  467  1e-130  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  40.43 
 
 
832 aa  444  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  42.91 
 
 
756 aa  445  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  43.07 
 
 
729 aa  429  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  32.08 
 
 
748 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  32.62 
 
 
749 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  36.95 
 
 
607 aa  376  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  41.8 
 
 
537 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  30.79 
 
 
750 aa  361  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>