96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0014 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
354 aa  700    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  86.4 
 
 
354 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  74.93 
 
 
350 aa  520  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  63.82 
 
 
350 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 
358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  31.09 
 
 
373 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  28.65 
 
 
357 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  29.11 
 
 
357 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 
352 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  27.32 
 
 
742 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  27.49 
 
 
351 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  28.99 
 
 
356 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  28.36 
 
 
355 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  29.72 
 
 
352 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  26.72 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 
344 aa  92.8  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  26.49 
 
 
333 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  28.35 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  22.63 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22.63 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.68 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  22.63 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  22.63 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  22.63 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  22.63 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  22.63 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  22.63 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  22.63 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  25.92 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  41.84 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  24.19 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  41.86 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  30.34 
 
 
386 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  30.91 
 
 
273 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  23.32 
 
 
353 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  23.5 
 
 
255 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  32.31 
 
 
249 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  24.86 
 
 
260 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  30.46 
 
 
267 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  31.08 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.81 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  26.94 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  24.53 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  26.63 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  25.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  25.16 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  27.33 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 
262 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  24.53 
 
 
261 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
267 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 
239 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  36 
 
 
273 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.64 
 
 
258 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  23.13 
 
 
261 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  23.9 
 
 
261 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.9 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.9 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  23.9 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.13 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 
272 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  35.58 
 
 
270 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  33.94 
 
 
243 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  25.22 
 
 
283 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 
276 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  33.77 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  29.05 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  32.04 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  23.47 
 
 
248 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 
224 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 
249 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  23.19 
 
 
272 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  23.19 
 
 
272 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  21.56 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  30.68 
 
 
119 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  31.75 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  24.18 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  24.18 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
261 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  27.03 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 
254 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  27.4 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 
250 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  28.08 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 
281 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>