More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0540 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  72.09 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  62.45 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  60.38 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  63.92 
 
 		 270 aa  327  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  62.16 
 
 		 263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  61.87 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  62.16 
 
 		 263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  59.39 
 
 		 265 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  57.92 
 
 		 262 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  61.18 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  60.54 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  63.57 
 
 		 264 aa  314  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  62.79 
 
 		 265 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  60 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  61 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  58.53 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  61.63 
 
 		 265 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  57.14 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  61.24 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  56.2 
 
 		 263 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  55.38 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  57.36 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  57.53 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  57.14 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  52.73 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  56.81 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  57.03 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  52.94 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  51.36 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  53.54 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  56.25 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  53.99 
 
 		 269 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  52.16 
 
 		 259 aa  261  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  59.73 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  47.91 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  50.2 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  54.62 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  47.88 
 
 		 259 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  46.46 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  43.92 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  45.38 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  45.28 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  46.77 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  45.49 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  46.42 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  49.03 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  46.88 
 
 		 459 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  45.7 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  45.7 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  42.47 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  45.31 
 
 		 260 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.19 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  45.66 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  49.22 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  44.03 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  46.72 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  49.22 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  46.36 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  43.66 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.44 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  46.04 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.44 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  44.91 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  44.11 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  48.45 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  44.92 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  44.19 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  44.19 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  43.8 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  40.15 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  45.98 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.37 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  44.32 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  43.41 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  44.53 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.11 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  43.8 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  43.41 
 
 		 269 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>