More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0084 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 287 aa  567  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  61.37 
 
 		 284 aa  338  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  58.27 
 
 		 283 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  57.55 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  56.74 
 
 		 283 aa  318  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  57.76 
 
 		 283 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  60.94 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  58.59 
 
 		 283 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  58.61 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  52.08 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  54.41 
 
 		 285 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.52 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  53.68 
 
 		 285 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  55.07 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  54.68 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50.9 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  54.29 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.4 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  48.57 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  50.92 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 287 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  43.64 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.94 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 287 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.81 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  50.17 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.89 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.6 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  52.34 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  43.32 
 
 		 282 aa  228  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 279 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  45.13 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  43.8 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 288 aa  222  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 282 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>