More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2754 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.06 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  47.8 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.34 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.7 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  48.65 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  54.35 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  44.75 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  41.3 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  40.66 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.86 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.27 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.74 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  32.22 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  38.3 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  34.98 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  40.83 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  40.83 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  40.83 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  40.83 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  40.83 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  40.83 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  40.14 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  40.83 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.32 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.96 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  37.8 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  31.71 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  31.25 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  36.43 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0980  hypothetical protein  29.94 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00272416  normal  0.0487785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.79 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.73 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.51 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.51 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  34.51 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.08 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.12 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.24 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  22.77 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.53 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.31 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  27.64 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.96 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  27.64 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  26.34 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  34.68 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  27.86 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.03 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.06 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  35.25 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  29.61 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  32.26 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  34.36 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>