More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2067 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  75.74 
 
 		 238 aa  354  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  76.19 
 
 		 254 aa  352  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  73.82 
 
 		 243 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  71.55 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  72.29 
 
 		 240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  70.69 
 
 		 244 aa  329  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  70.69 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  71.12 
 
 		 251 aa  326  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  70.82 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  64.96 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  67.65 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  69.4 
 
 		 245 aa  320  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  66.95 
 
 		 238 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  66.24 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  68 
 
 		 244 aa  311  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  66.09 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  65.52 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  66.67 
 
 		 235 aa  304  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  64.53 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  64.07 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  65.15 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  66.23 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  69.26 
 
 		 241 aa  297  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  66.38 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  65.81 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  63.91 
 
 		 245 aa  294  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  62.55 
 
 		 235 aa  293  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  65.33 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  61.9 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  59.91 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  59.74 
 
 		 234 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  59.74 
 
 		 234 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  60.79 
 
 		 234 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  67.98 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  54.55 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.25 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  51.91 
 
 		 239 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  56.64 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  52.38 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  51.54 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  48.23 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.22 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  50.66 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  48.88 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  55.5 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.11 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  49.57 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  49.11 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  44.78 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  46.58 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  44.54 
 
 		 232 aa  225  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.49 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  45.81 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.71 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  50.67 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 345 aa  214  7e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.11 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  43.04 
 
 		 604 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  48.42 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.47 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.4 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.35 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  51.67 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  49.3 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  45.89 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.02 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  50.72 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.34 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  51.42 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  49.13 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.85 
 
 		 288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  48.84 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.87 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  47.32 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  49.54 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  51.2 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.32 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>