128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0100 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  69.65 
 
 		 201 aa  288  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  66.83 
 
 		 201 aa  266  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  67.34 
 
 		 199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  56.93 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  53.96 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  40.7 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  44.27 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  42.5 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  41.5 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  39.59 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  40.39 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  38.83 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  39.8 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  41.24 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  41.12 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  41.09 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  36.41 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  32.18 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  33 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  32.5 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  32.84 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  26.5 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  32.99 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  24.61 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  25.25 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  22.68 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  22.45 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  25.24 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  29.32 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.89 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>