More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7561 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.85 
 
 		 731 aa  731    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.23 
 
 		 781 aa  666    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.58 
 
 		 723 aa  747    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.38 
 
 		 753 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.94 
 
 		 740 aa  739    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.11 
 
 		 769 aa  734    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.17 
 
 		 759 aa  715    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.74 
 
 		 742 aa  728    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.73 
 
 		 754 aa  702    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  49.11 
 
 		 722 aa  657    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.81 
 
 		 715 aa  663    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.21 
 
 		 852 aa  644    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.23 
 
 		 784 aa  671    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  82.04 
 
 		 704 aa  1154    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.01 
 
 		 740 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.54 
 
 		 768 aa  728    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  100 
 
 		 757 aa  1494    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  94.85 
 
 		 757 aa  1427    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  51.08 
 
 		 754 aa  704    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  55.26 
 
 		 763 aa  820    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  49.61 
 
 		 775 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  56.39 
 
 		 764 aa  832    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.61 
 
 		 754 aa  711    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  80.03 
 
 		 755 aa  1206    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  49.86 
 
 		 718 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.53 
 
 		 737 aa  695    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.81 
 
 		 781 aa  655    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.27 
 
 		 742 aa  748    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  67.78 
 
 		 772 aa  1004    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.8 
 
 		 757 aa  701    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.19 
 
 		 737 aa  686    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  48.98 
 
 		 810 aa  689    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.46 
 
 		 743 aa  732    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.12 
 
 		 731 aa  734    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.07 
 
 		 754 aa  694    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.53 
 
 		 736 aa  653    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.52 
 
 		 738 aa  735    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.17 
 
 		 805 aa  641    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.57 
 
 		 800 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.27 
 
 		 805 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.7 
 
 		 801 aa  653    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  68.82 
 
 		 773 aa  1035    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.88 
 
 		 808 aa  701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.74 
 
 		 735 aa  691    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47 
 
 		 701 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.53 
 
 		 754 aa  699    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.46 
 
 		 736 aa  720    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  50.82 
 
 		 713 aa  675    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.61 
 
 		 727 aa  758    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.69 
 
 		 738 aa  766    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.61 
 
 		 739 aa  736    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.68 
 
 		 719 aa  706    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.85 
 
 		 721 aa  737    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.09 
 
 		 756 aa  844    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.65 
 
 		 806 aa  708    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 760 aa  712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.57 
 
 		 731 aa  731    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.3 
 
 		 732 aa  806    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.33 
 
 		 718 aa  768    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.06 
 
 		 738 aa  692    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.44 
 
 		 731 aa  731    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.19 
 
 		 709 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  48.3 
 
 		 732 aa  631  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.45 
 
 		 810 aa  626  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.47 
 
 		 763 aa  628  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.22 
 
 		 804 aa  624  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  44.75 
 
 		 814 aa  612  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  45.43 
 
 		 804 aa  614  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.82 
 
 		 730 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.69 
 
 		 801 aa  612  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  42.49 
 
 		 721 aa  608  9.999999999999999e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  44.74 
 
 		 829 aa  602  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  44.71 
 
 		 810 aa  601  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  44.34 
 
 		 806 aa  591  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  46.69 
 
 		 826 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  46.02 
 
 		 703 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  44.3 
 
 		 739 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  44.82 
 
 		 746 aa  531  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  43.89 
 
 		 699 aa  531  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  47.13 
 
 		 685 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  46.05 
 
 		 703 aa  512  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  43.39 
 
 		 776 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  40.67 
 
 		 930 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  51.11 
 
 		 613 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  49.04 
 
 		 639 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  49.65 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  51.23 
 
 		 601 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  48.18 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  46.21 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  46.3 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  43.01 
 
 		 803 aa  456  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  41.91 
 
 		 832 aa  453  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  44.05 
 
 		 788 aa  449  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  43.06 
 
 		 729 aa  429  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  39.67 
 
 		 756 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  35.11 
 
 		 749 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  36.6 
 
 		 748 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.48554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  37.06 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  35.91 
 
 		 750 aa  361  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  43.58 
 
 		 537 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>