More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7377 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  332  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  88.17 
 
 		 169 aa  296  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  74.85 
 
 		 441 aa  238  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  74.23 
 
 		 174 aa  236  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  71.78 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  61.82 
 
 		 456 aa  190  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  36.24 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  35.96 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 327 aa  70.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  29.05 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 340 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  36.89 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  34.65 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 341 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 131 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 129 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  32.45 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  32.35 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  31.37 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  33.66 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  33.63 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.59 
 
 		 329 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.59 
 
 		 329 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 383 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  37.97 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  34.86 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  32.61 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 305 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  36.71 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  46.97 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  39.13 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  30.97 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  33.05 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  36.71 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.65 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  36.71 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  33.05 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  41.56 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 347 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  28.37 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  46.77 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  32.2 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  43.75 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  40.98 
 
 		 430 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  35.23 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  36.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  33.05 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.66 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.64 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  46.77 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>