More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1356 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  80.24 
 
 
573 aa  917  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
582 aa  1147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  80.94 
 
 
583 aa  927  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  66.55 
 
 
611 aa  695  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  68.29 
 
 
610 aa  712  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  76.08 
 
 
573 aa  859  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  65.58 
 
 
585 aa  657  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 
582 aa  1147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  62.85 
 
 
582 aa  660  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  61.32 
 
 
581 aa  668  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  61.32 
 
 
581 aa  668  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  63.57 
 
 
582 aa  669  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  99.14 
 
 
582 aa  1140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  60.54 
 
 
580 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  61.47 
 
 
592 aa  621  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  57.12 
 
 
629 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  62.36 
 
 
694 aa  603  1e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  61.2 
 
 
586 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  56.58 
 
 
602 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  55.81 
 
 
602 aa  548  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  52.77 
 
 
531 aa  517  1e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  50.48 
 
 
664 aa  512  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  55.8 
 
 
531 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  44.59 
 
 
663 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  54.41 
 
 
574 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  45.39 
 
 
671 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  59.3 
 
 
525 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  47.61 
 
 
577 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  47.41 
 
 
639 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  44.26 
 
 
678 aa  466  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  47.52 
 
 
662 aa  467  1e-130  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  46.91 
 
 
600 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  47.67 
 
 
651 aa  446  1e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  44.42 
 
 
573 aa  417  1e-115  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  42.21 
 
 
503 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  45.22 
 
 
498 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  45.25 
 
 
606 aa  407  1e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  43.57 
 
 
523 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  43.69 
 
 
558 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  42.02 
 
 
546 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  42.38 
 
 
580 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  42.44 
 
 
603 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  42.69 
 
 
506 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  41.94 
 
 
494 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  42.32 
 
 
504 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  41.62 
 
 
504 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  40.4 
 
 
548 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.12445e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  41.13 
 
 
490 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  41.34 
 
 
505 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 
508 aa  389  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  41.34 
 
 
505 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  41.34 
 
 
505 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  40.4 
 
 
548 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  41.54 
 
 
505 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  41.34 
 
 
505 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  41.54 
 
 
505 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  41.54 
 
 
505 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  38.22 
 
 
532 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  44.57 
 
 
659 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  41.22 
 
 
504 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83656e-05 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  44.57 
 
 
659 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  41.14 
 
 
505 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  43.6 
 
 
497 aa  382  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  37.96 
 
 
516 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.02789e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  38.27 
 
 
516 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  38.27 
 
 
516 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  43.55 
 
 
637 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  38.08 
 
 
516 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.5754e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  38.27 
 
 
516 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  38.22 
 
 
516 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  42.16 
 
 
657 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  38.08 
 
 
516 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  38.08 
 
 
516 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  41.21 
 
 
520 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  37.69 
 
 
516 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.13352e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  41.21 
 
 
520 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0292  BCCT transporter  49.87 
 
 
513 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  37.69 
 
 
516 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.51893e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.71 
 
 
637 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  40.48 
 
 
567 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  40.99 
 
 
556 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01900  choline/carnitine/betaine transport  41.14 
 
 
619 aa  364  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  38.48 
 
 
574 aa  363  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  45.8 
 
 
533 aa  362  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  47.05 
 
 
593 aa  361  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  42.09 
 
 
698 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  42.72 
 
 
549 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  38.54 
 
 
554 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  40.14 
 
 
539 aa  359  8e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  41.88 
 
 
545 aa  359  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  41.3 
 
 
661 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  41.6 
 
 
667 aa  357  4e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  36.84 
 
 
530 aa  357  4e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  39.92 
 
 
544 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  43.4 
 
 
572 aa  355  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  44.03 
 
 
642 aa  353  3e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  40.88 
 
 
523 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  44.17 
 
 
583 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  37.28 
 
 
606 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  41.21 
 
 
534 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>