More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0292 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0292  BCCT transporter  100 
 
 		 513 aa  1016    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  62.05 
 
 		 664 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  51.73 
 
 		 671 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  48.84 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  50.78 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  49.21 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  49.87 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  49.87 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  49.87 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  44.77 
 
 		 663 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  43.12 
 
 		 639 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  44.34 
 
 		 678 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  46.19 
 
 		 662 aa  349  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  47.67 
 
 		 610 aa  342  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  47.29 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  43.18 
 
 		 651 aa  333  5e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  42.3 
 
 		 582 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  44.56 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  44.56 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  44.04 
 
 		 582 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  45.28 
 
 		 629 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  42.42 
 
 		 580 aa  319  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  44.01 
 
 		 585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  43.26 
 
 		 592 aa  313  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  45.04 
 
 		 694 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  42.39 
 
 		 602 aa  293  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  39.24 
 
 		 602 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  41.08 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  40.91 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  44.72 
 
 		 574 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  40.91 
 
 		 600 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  41.55 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  41.21 
 
 		 546 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  37.7 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  38.16 
 
 		 577 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  39.01 
 
 		 558 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  41.19 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  38.92 
 
 		 490 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  39.77 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  39.77 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  37.23 
 
 		 534 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  38.14 
 
 		 505 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  38.14 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  38.14 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  38.14 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  37.85 
 
 		 505 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  37.85 
 
 		 504 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  37.85 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  37.85 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  37.85 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  41.6 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  39.13 
 
 		 572 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  38.57 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  38.62 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  37.96 
 
 		 642 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  36.28 
 
 		 637 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  36.61 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  38.67 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  36.49 
 
 		 523 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  36.23 
 
 		 574 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  34.86 
 
 		 523 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  36.41 
 
 		 532 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  36.26 
 
 		 544 aa  223  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  38.51 
 
 		 506 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  34.77 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  35.49 
 
 		 530 aa  220  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  35.55 
 
 		 526 aa  219  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  36.68 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  36.68 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  37.54 
 
 		 659 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  37.54 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  34.05 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  36.57 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  34.67 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  36.39 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  36.39 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  36.16 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  36.39 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  36.39 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  36.1 
 
 		 516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  34.53 
 
 		 657 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  35.07 
 
 		 676 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  35.07 
 
 		 676 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  35.07 
 
 		 676 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  35.07 
 
 		 716 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  36.21 
 
 		 516 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  35.07 
 
 		 716 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  36.26 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  35.13 
 
 		 503 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  39.55 
 
 		 606 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  34.84 
 
 		 676 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  36.26 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  36.98 
 
 		 593 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  36.1 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  34.79 
 
 		 676 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  34.79 
 
 		 676 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  37.36 
 
 		 568 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003138  High-affinity choline uptake protein BetT  36.42 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000429409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  34.18 
 
 		 606 aa  213  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3038  choline/carnitine/betaine transporter  39.47 
 
 		 554 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>