132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1365 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  709    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  43.02 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  41.29 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  42.05 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  39.36 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  37.57 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  37.98 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  35.53 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  34.83 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  32.85 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  33.72 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  33.24 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  28.69 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  30.7 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.01 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  30.58 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  29.5 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.57 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  30.03 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  23.96 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  31.49 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  32.4 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  27.76 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  30.5 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.47 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  30.48 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  26.93 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  30.6 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  27.21 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  26.78 
 
 		 400 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  27.69 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  27.79 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  28.49 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.1 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.07 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  25.8 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  28 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  32.31 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  24.34 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  24.34 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  25.66 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  22.7 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  31.11 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  25.83 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.24 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  29.02 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  31.22 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  28.62 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  25.93 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  34.68 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  34.68 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  34.68 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  22.27 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  28.51 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  30.38 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  25.21 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  23.71 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  26.95 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  27.84 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 173 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.88 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 173 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  31.93 
 
 		 390 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  26.45 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0468  helix-turn-helix domain protein  29.81 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  29.59 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  27.82 
 
 		 147 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.51 
 
 		 505 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  23.46 
 
 		 419 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  24.69 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  29.59 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  39.73 
 
 		 149 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  31.91 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  26.53 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  22.04 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.47 
 
 		 122 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.47 
 
 		 122 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  22.55 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 149 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.47 
 
 		 122 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  22.83 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 92 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  27.13 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  26.16 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>