More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1673 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  33.92 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  31.94 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1946  cytochrome c553  30.68 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.871766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  32.57 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.09 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  32.76 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  30.35 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003775  cytochrome c553  33.06 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  28.93 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  30.72 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  28.65 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 116 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  30.6 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  45.83 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  42.35 
 
 		 103 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  29.45 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  26.92 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  30.19 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  26.44 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  26.96 
 
 		 373 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.1 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  25.49 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  31.3 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  39.24 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  26.86 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  24.55 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  33 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  25.76 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  41.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  26.77 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  29.72 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  29.78 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  29.2 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  29.78 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 107 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 105 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  32.2 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  29.78 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  38.57 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  27.59 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  34.11 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  34.11 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  24.72 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  34.11 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  30 
 
 		 104 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  27.65 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  27.32 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  28.76 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.61 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  29.94 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 102 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  30 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  26.53 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 115 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  40 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  31.08 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  28.36 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  40 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  26.42 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  25.88 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  26.45 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  26.97 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  32 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  39.24 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  27.32 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  32.85 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  28.8 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  26.63 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0029  cytochrome c553  29.73 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  28.05 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  28 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  38.89 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  24.18 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  26.45 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  27.1 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  29.38 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  28.85 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  26.73 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  26.83 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>