144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2606 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 429 aa  881    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  33.25 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  32.72 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  43.56 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  44.17 
 
 		 487 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  35.1 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  29.36 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  32.81 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  30.4 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  28.54 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  36.96 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  43.03 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  39 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  39.61 
 
 		 471 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  39.78 
 
 		 538 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  32.95 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.57 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.75 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  30.84 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  38.31 
 
 		 846 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  29.8 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  28.95 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  31.73 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  28.09 
 
 		 564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.68 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.55 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.31 
 
 		 429 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.65 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.01 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  28.38 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  47.5 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.33 
 
 		 572 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  33.43 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  32.97 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  28.66 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.73 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  27.41 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.87 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.89 
 
 		 441 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  31.37 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  38.28 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  25.29 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  25.76 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  30.82 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  29.24 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.49 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1253  Type I restriction enzyme EcoAI specificity protein  37.08 
 
 		 597 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00376854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  29.7 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.79 
 
 		 565 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  28.28 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  28.41 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  32.38 
 
 		 437 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  28.99 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.84 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.75 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  26.76 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  31.84 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  24.68 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  29.32 
 
 		 474 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  27.79 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  54.67 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  29.04 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.78 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.51 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  27.3 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  24.6 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  31.5 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  26.26 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  25.86 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  26.91 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.65 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  23 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  33.33 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  28.74 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  24.5 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  32.89 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  29.67 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  23.42 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  32.17 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.37 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  27.9 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  32.1 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  25.32 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  25.65 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  23.22 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  24.75 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.18 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  32.12 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  22.68 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  19.1 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  21.8 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  35.48 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  23.19 
 
 		 590 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.2 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  27.33 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.1 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.15 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  21.71 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.67 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>