201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2734 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  67.34 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  55.5 
 
 		 203 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  55.38 
 
 		 203 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  36.26 
 
 		 404 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  38.27 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.04 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  35.5 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.52 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  31.28 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  35.42 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.43 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  36.07 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.52 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  30.27 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  50.75 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  32.94 
 
 		 946 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  44.87 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  26.02 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.11 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.87 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  39.19 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  50.91 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.72 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 77 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  25.14 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.12 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.84 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.8 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  24.87 
 
 		 457 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.31 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  23.53 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  43.04 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.31 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.29 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.79 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  44.44 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.62 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.44 
 
 		 182 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 		 447 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 170 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.42 
 
 		 234 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.15 
 
 		 412 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.33 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.06 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  38.46 
 
 		 762 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 974 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  49.12 
 
 		 409 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  44.26 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.77 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.79 
 
 		 245 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.88 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  40.62 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  42.31 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.42 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 360 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  38.33 
 
 		 2277 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  40.79 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  46.43 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.36 
 
 		 629 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  41.49 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2852  hypothetical protein  46.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  42.86 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 559 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  43.86 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.4 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  47.37 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  43.94 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  38.1 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  34.21 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  34.23 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  34.19 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>