191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0097 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  99.63 
 
 		 271 aa  543  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  100 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  43.38 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  44.89 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  43.07 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  41.82 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  40.57 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  40.57 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  40.81 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  40.66 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  40.14 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  42.09 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  39.71 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  40.43 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  41.97 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  40.81 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  42.34 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  41.03 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  39.71 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  38.27 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  37.86 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  40.81 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  39.27 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  38.91 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  37.63 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  36.1 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  34.77 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  37.18 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  37.72 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  40.51 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  36.56 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  34.51 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  33.68 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  33.68 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  33.92 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.69 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.63 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.68 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.88 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.33 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  31.45 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.38 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.38 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.38 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.38 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  42.66 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  36.31 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  42.66 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  33.76 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.63 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  33.88 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  33.57 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  33.96 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  29.45 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  33.8 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  35.11 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.83 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.64 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  31.77 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  34.04 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 		 308 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  30.15 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.54 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.85 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.04 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.37 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  30.39 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  38.73 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  36.7 
 
 		 280 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  34.76 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  38.42 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  36.76 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  38.42 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.46 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>