More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1679 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.88 
 
 		 909 aa  1316    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  41.85 
 
 		 946 aa  704    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  42.49 
 
 		 943 aa  729    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  44.69 
 
 		 955 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  43.3 
 
 		 939 aa  726    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.97 
 
 		 897 aa  1275    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  64.59 
 
 		 898 aa  1194    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.44 
 
 		 944 aa  814    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.84 
 
 		 932 aa  772    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  42.52 
 
 		 954 aa  694    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.97 
 
 		 972 aa  697    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 903 aa  1839    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  61.67 
 
 		 903 aa  1152    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.96 
 
 		 890 aa  539  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.89 
 
 		 927 aa  538  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 		 928 aa  529  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 		 916 aa  525  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.46 
 
 		 937 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 928 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 		 916 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 		 926 aa  505  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 		 970 aa  500  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.54 
 
 		 912 aa  492  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 915 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 		 913 aa  474  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 946 aa  465  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 		 905 aa  440  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.18 
 
 		 913 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.57 
 
 		 1688 aa  336  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.43 
 
 		 888 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.64 
 
 		 875 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 931 aa  310  6.999999999999999e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.9 
 
 		 933 aa  303  9e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 900 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.39 
 
 		 873 aa  297  8e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.98 
 
 		 1480 aa  283  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.67 
 
 		 872 aa  273  9e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.25 
 
 		 872 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.32 
 
 		 1388 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  27.39 
 
 		 874 aa  266  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.64 
 
 		 874 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.7 
 
 		 1517 aa  264  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.51 
 
 		 874 aa  263  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.99 
 
 		 1476 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.3 
 
 		 1426 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  30.02 
 
 		 1523 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 		 1475 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 		 1523 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 		 1514 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 1523 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  31.51 
 
 		 1567 aa  258  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 		 1516 aa  258  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.74 
 
 		 1429 aa  258  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  31.83 
 
 		 1419 aa  258  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  35.41 
 
 		 1434 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  31.71 
 
 		 1584 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  33.76 
 
 		 1513 aa  255  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  29.45 
 
 		 1544 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  30.95 
 
 		 1493 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.05 
 
 		 870 aa  254  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  32.99 
 
 		 1573 aa  253  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  28.27 
 
 		 915 aa  253  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.64 
 
 		 922 aa  253  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.07 
 
 		 1502 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.08 
 
 		 1535 aa  252  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  31.49 
 
 		 1509 aa  251  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  36.2 
 
 		 1448 aa  251  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  32.69 
 
 		 925 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.76 
 
 		 1451 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  35.08 
 
 		 1431 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  35.48 
 
 		 1448 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.6 
 
 		 1508 aa  248  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  32.19 
 
 		 1534 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.96 
 
 		 1480 aa  247  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  26.22 
 
 		 914 aa  247  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 		 1497 aa  246  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  32.3 
 
 		 925 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 1534 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.34 
 
 		 1518 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 1505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  31.61 
 
 		 1632 aa  244  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  35.37 
 
 		 1515 aa  244  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  28.33 
 
 		 1495 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 1553 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.07 
 
 		 1539 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.59 
 
 		 1561 aa  239  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.91 
 
 		 1538 aa  239  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.07 
 
 		 1412 aa  238  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  28.64 
 
 		 1435 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.97 
 
 		 854 aa  238  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  28.81 
 
 		 1538 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.81 
 
 		 1538 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1538 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  28.81 
 
 		 1538 aa  237  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.95 
 
 		 1506 aa  237  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.81 
 
 		 1538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.29 
 
 		 1510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  33.72 
 
 		 1504 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  29.28 
 
 		 1536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  29.04 
 
 		 1536 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>