263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3560 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  49.47 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.82 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.14 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  33.69 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  33.57 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.42 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  30.21 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  30.07 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  26.43 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  34.18 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  43.75 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  26.3 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  28.11 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  27.15 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  28.11 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.87 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  29.43 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  26.13 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  26.99 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  26.76 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  25.27 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  27.4 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  28.78 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  25.84 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  29.67 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  26.74 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  32.5 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  25.52 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  23.08 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  25.96 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  25.68 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  42.25 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  24.53 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  24.01 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.68 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  26.97 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.86 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.33 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  23.29 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  41.86 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  37.65 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  21.55 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  38.82 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  36.14 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  24.57 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  40.28 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  23.26 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  29.51 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  25.94 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  46.88 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  30.56 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  52 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 146 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  26.11 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>