More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1670 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 		 955 aa  1954    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  48.53 
 
 		 943 aa  923    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  48.48 
 
 		 939 aa  914    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  47.41 
 
 		 954 aa  880    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  48.22 
 
 		 946 aa  902    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  45.03 
 
 		 898 aa  797    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  69.67 
 
 		 944 aa  1399    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.88 
 
 		 972 aa  880    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.74 
 
 		 932 aa  1012    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.8 
 
 		 903 aa  789    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.09 
 
 		 897 aa  769    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  43.95 
 
 		 903 aa  783    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.31 
 
 		 909 aa  813    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.3 
 
 		 970 aa  615  1e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.07 
 
 		 927 aa  619  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.59 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.02 
 
 		 937 aa  612  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.09 
 
 		 928 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.95 
 
 		 890 aa  606  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.73 
 
 		 926 aa  585  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.56 
 
 		 916 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.38 
 
 		 916 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.37 
 
 		 915 aa  568  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.19 
 
 		 912 aa  558  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.96 
 
 		 913 aa  545  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.79 
 
 		 946 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.91 
 
 		 905 aa  479  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.91 
 
 		 913 aa  449  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  31.85 
 
 		 1688 aa  382  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.22 
 
 		 875 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  31.74 
 
 		 873 aa  358  1.9999999999999998e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  31.1 
 
 		 1480 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.07 
 
 		 888 aa  340  8e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 1476 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.7 
 
 		 872 aa  336  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.58 
 
 		 870 aa  335  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.57 
 
 		 874 aa  327  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.64 
 
 		 874 aa  325  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.34 
 
 		 874 aa  325  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.33 
 
 		 872 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.98 
 
 		 933 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.22 
 
 		 931 aa  310  5.9999999999999995e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  28.65 
 
 		 915 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  30.73 
 
 		 1536 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  30.61 
 
 		 1536 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  30.28 
 
 		 1536 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.88 
 
 		 941 aa  299  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 		 1514 aa  296  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.82 
 
 		 914 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  28.49 
 
 		 1573 aa  294  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.9 
 
 		 922 aa  293  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.47 
 
 		 1553 aa  294  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  29.91 
 
 		 1388 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.67 
 
 		 1538 aa  293  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.71 
 
 		 1495 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 		 1502 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.59 
 
 		 1506 aa  291  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  28.67 
 
 		 1538 aa  289  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  28.67 
 
 		 1538 aa  289  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1538 aa  289  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 1534 aa  289  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.67 
 
 		 1538 aa  289  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.34 
 
 		 1538 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.56 
 
 		 1538 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.56 
 
 		 1525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  28.96 
 
 		 1435 aa  284  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  30.51 
 
 		 1535 aa  281  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  30.57 
 
 		 1584 aa  281  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.09 
 
 		 1412 aa  281  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1429 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.82 
 
 		 1517 aa  278  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  30.16 
 
 		 1544 aa  277  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.96 
 
 		 1508 aa  277  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  29.02 
 
 		 1531 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.1 
 
 		 1523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 1523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 1523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 		 1505 aa  274  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  28.92 
 
 		 1523 aa  273  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  30.4 
 
 		 1419 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1497 aa  273  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  29.43 
 
 		 1572 aa  272  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 1475 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  30.08 
 
 		 1509 aa  271  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.28 
 
 		 1480 aa  271  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  29.98 
 
 		 1493 aa  271  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  32.68 
 
 		 1515 aa  270  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 1518 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.14 
 
 		 1567 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 1426 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  29.03 
 
 		 1513 aa  268  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  27.74 
 
 		 1504 aa  267  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  29.08 
 
 		 1434 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  32.07 
 
 		 1534 aa  266  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.39 
 
 		 1381 aa  265  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  27.37 
 
 		 1601 aa  265  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.54 
 
 		 900 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 1516 aa  264  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 		 1539 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  31.31 
 
 		 1599 aa  262  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>