More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0100 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1182 aa  2413    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  33.73 
 
 
1322 aa  332  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
765 aa  317  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
1011 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  43.26 
 
 
615 aa  312  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  41.46 
 
 
982 aa  306  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 
1331 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
773 aa  302  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
1363 aa  298  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
870 aa  299  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1064 aa  298  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.03 
 
 
923 aa  297  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
1165 aa  296  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 
1765 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1310 aa  291  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.48 
 
 
1442 aa  291  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  39.54 
 
 
803 aa  290  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.32 
 
 
2213 aa  289  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  34.38 
 
 
662 aa  290  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1340 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1452 aa  288  4e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1255 aa  288  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.02 
 
 
1763 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  40.8 
 
 
758 aa  286  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  37.77 
 
 
810 aa  286  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
921 aa  284  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.62 
 
 
1135 aa  283  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
865 aa  283  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1266 aa  283  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.04 
 
 
2035 aa  281  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.7 
 
 
1177 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
764 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1033 aa  280  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.28 
 
 
1765 aa  278  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
957 aa  278  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1398 aa  277  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  33.96 
 
 
666 aa  277  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
791 aa  277  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1075 aa  277  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.84 
 
 
631 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 
1626 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  36.94 
 
 
823 aa  275  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1659 aa  274  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
969 aa  274  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.95 
 
 
1179 aa  274  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  33.93 
 
 
1023 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
916 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
817 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1767 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1767 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1596 aa  273  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
876 aa  273  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1260 aa  273  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1116 aa  272  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1611 aa  272  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
873 aa  271  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
1768 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1267 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
846 aa  270  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
1407 aa  270  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  35.49 
 
 
853 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1410 aa  270  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1433 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1369 aa  269  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1771 aa  270  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.63 
 
 
968 aa  269  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 
847 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  35.11 
 
 
2109 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1397 aa  269  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1040 aa  268  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
770 aa  268  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1110 aa  268  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
929 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.19 
 
 
982 aa  266  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1238 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1127 aa  266  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1070 aa  266  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1238 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1177 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
973 aa  265  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  35.85 
 
 
1346 aa  265  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
1767 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1548 aa  265  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  28.12 
 
 
1683 aa  264  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1234 aa  264  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1238 aa  264  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
982 aa  264  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
939 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
924 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 
1001 aa  263  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  39.2 
 
 
539 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.38 
 
 
1407 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1238 aa  263  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1313 aa  263  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1582 aa  263  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
803 aa  263  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1193 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
877 aa  262  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
950 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1193 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>