More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3596 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  77.2 
 
 		 198 aa  289  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  49.78 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  47.83 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  44.98 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  48.05 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  44.58 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  41.74 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  43.91 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  43.04 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  40.79 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.54 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  40.35 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  41.56 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  39.66 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  40.79 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  44.74 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  37.34 
 
 		 226 aa  158  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  38.6 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  43.04 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  37.28 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  44.59 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  44.74 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  40.95 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  35.09 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  29.82 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  44.03 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  41.72 
 
 		 339 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 		 149 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  42.04 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  36.42 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  36.42 
 
 		 149 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.93 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  36.18 
 
 		 152 aa  99.4  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  38.26 
 
 		 201 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.99 
 
 		 153 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  40.27 
 
 		 132 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  36.99 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  38.78 
 
 		 149 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 149 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  36.6 
 
 		 153 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  35.43 
 
 		 332 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 149 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 		 147 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  35.03 
 
 		 151 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.6 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  37.58 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  41.84 
 
 		 333 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 154 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.48 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.24 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 427 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  37.43 
 
 		 330 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.88 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  28.7 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.57 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.01 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.77 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  41.61 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.77 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.48 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  31.15 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  33.78 
 
 		 153 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.54 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  29.56 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.18 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.16 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.09 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.28 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  33.04 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  28.19 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  35.26 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.8 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.52 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  30.26 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  33.57 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34.62 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 620 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.33 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.65 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.7 
 
 		 279 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>