More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2309 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  94.42 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  83.66 
 
 		 276 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  83.27 
 
 		 273 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  80.3 
 
 		 282 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  82.88 
 
 		 275 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  77.44 
 
 		 280 aa  428  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  83.46 
 
 		 296 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  75.29 
 
 		 269 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  76.86 
 
 		 265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  76.77 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.29 
 
 		 269 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  73.31 
 
 		 266 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  75 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  61.75 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  64.06 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  59.04 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  60.24 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.48 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  59.04 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  59.04 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  59.36 
 
 		 270 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  58.63 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  57.83 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  57.43 
 
 		 260 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  57.43 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  57.83 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  57.77 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  56.97 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  56.22 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  57.03 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.03 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  56.18 
 
 		 277 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  52.4 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  57.03 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  57.43 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  57.03 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  57.81 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  56.63 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  50.56 
 
 		 276 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  55.02 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  56.13 
 
 		 289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  55.86 
 
 		 277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  57.54 
 
 		 264 aa  279  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  58.63 
 
 		 255 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  53.21 
 
 		 277 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.83 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  55.82 
 
 		 260 aa  271  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  54.65 
 
 		 278 aa  271  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  57.96 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  54.62 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  54 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  49.07 
 
 		 275 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 292 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  54.62 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  52.57 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.57 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  48.31 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  50.78 
 
 		 285 aa  254  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  51.41 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  50.39 
 
 		 274 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 268 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  52.21 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  47.31 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.78 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  45.59 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  47.24 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  46.64 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  48.4 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  48 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.03 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.43 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  48.8 
 
 		 256 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.98 
 
 		 268 aa  232  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  48.4 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  44.11 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  44.27 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.79 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  44.27 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.67 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  43.87 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.09 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  47.24 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  45.08 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42.69 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  45.7 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>