More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1216 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  54.62 
 
 		 420 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 330 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  37.5 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.04 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  50 
 
 		 293 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.46 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.8 
 
 		 1048 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.94 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.52 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  38.19 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  29.29 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 495 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 452 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  40.35 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  36.89 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 480 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  31.85 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.33 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 388 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  33.51 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.73 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  30.59 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  42.73 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 116 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  40.21 
 
 		 395 aa  72  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  34.03 
 
 		 284 aa  72  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.85 
 
 		 331 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  32.88 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  30.94 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  38.98 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  35.92 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.47 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.52 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.72 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  31.79 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 353 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.4 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.59 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  36.23 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  40.82 
 
 		 389 aa  67  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  35.53 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.92 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  35.86 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  37.29 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  40 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  33.11 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  41 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  36.57 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  27.88 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  37 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  37.63 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  34.59 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.64 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>