250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1047 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  47.06 
 
 		 236 aa  179  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  31.02 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  26.87 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  29.71 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.54 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  31.72 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28.53 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.86 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  29.67 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  29.09 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.64 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  27.21 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  26.62 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  29.66 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.37 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  27.66 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  29.32 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.21 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  24.63 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.78 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  25.55 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.55 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  25.68 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  27.42 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  27.57 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  29.24 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  23.93 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  25.48 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  26.81 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  27.02 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  28.31 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  29.6 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  24.73 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  26.95 
 
 		 505 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  26.52 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  27.8 
 
 		 312 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  27.8 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  28.68 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  27.06 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.06 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  27.72 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  27.11 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.12 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  28.06 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  27.55 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  27.55 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  24.22 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  27.08 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  28.78 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  26.7 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  27.14 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  27.31 
 
 		 311 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  27.56 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.28 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.62 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  27.44 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.37 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.33 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  27.72 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  27.34 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  28.36 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  26.86 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.96 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  25.46 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  26.94 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  26.8 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  26.94 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  26.22 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  22.11 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  23.69 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  23.14 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  27.24 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  25.9 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  25.82 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  24.35 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  21.14 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  25.91 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  24.11 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  26.2 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  24.09 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  21.77 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  25.94 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  25.55 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  26.3 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  27.86 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  25.36 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  25.71 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  26.92 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  25.71 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  25.71 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  25.71 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  25.71 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  25.71 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  23.62 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  23.57 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  23.59 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>