More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 312 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  58.39 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  55.89 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  58.62 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  59.31 
 
 		 293 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  56.01 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  54.81 
 
 		 315 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  55.78 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  55.86 
 
 		 289 aa  319  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  54.72 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  57.86 
 
 		 313 aa  315  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  53.87 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  57.34 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  53.53 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  57.72 
 
 		 339 aa  311  7.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  56.55 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  57.34 
 
 		 314 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  53.77 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  57.64 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  55.75 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  50.84 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  49.84 
 
 		 335 aa  289  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  52.41 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  55.12 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  52.04 
 
 		 341 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  51.03 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  51.18 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  52.4 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  51.18 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  51.18 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 313 aa  278  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  47.47 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  51.7 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44.59 
 
 		 317 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  48.81 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 		 535 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.39 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.39 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 534 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  42.23 
 
 		 483 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 622 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  41.37 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 		 586 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  43.69 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 624 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  42.25 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  39.53 
 
 		 472 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  38.64 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  39.4 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  39.67 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  41.83 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38.01 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  41.33 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  37.83 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  37.42 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  41.33 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  44.19 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  40.59 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  40.59 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 		 482 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  36.93 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  36.39 
 
 		 478 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  37.21 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  41.33 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  36.39 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.39 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  36.93 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>